Vạn Khánh là một xã nông nghiệp nằm phía Bắc huyện Vạn Ninh (thị trấn Vạn Giã) 10km, trải dài từ thôn Hội Khánh Đông, xã Vạn Khánh đến thôn Ninh Lâm, xã Vạn Khánh với chiều dài bờ biển trên 02 km và diện tích tự nhiên 41,68 km2. Hệ thống giao thông đường bộ, đường sắt trên địa bàn xã tương đối đầy đủ, phục vụ tốt nhu cầu đi lại, trao đổi hàng hoá của nhân dân và đẩy mạnh phát triển kinh tế xã hội.
Địa hình của Vạn Khánh phong phú, bao gồm cả đồi núi, đồng bằng, và vùng biển. Biển Vạn Khánh nằm trong vịnh Vân Phong.
Do địa hình phong phú, đa dạng nên việc quy hoạch phát triển các ngành nghề nuôi trồng thuỷ sản như: tôm hùm, ốc hương và các loại hải sản khác sẽ không bị ảnh hưởng lớn bởi các dự án phát triển du lịch và xây dựng cảng biển; đồng thời, tạo điều kiện giải quyết lao động ở nông thôn nhằm từng bước ổn định đời sống nhân dân; đảm bảo an ninh chính trị, trật tự an toàn xã hội trên địa bàn.
Ngoài các cơ sở công nghiệp qui mô lớn của tỉnh và huyện. Trên địa bàn xã còn có các nhà máy khai thác có hiệu quả tiềm năng khoáng sản, vật liệu xây dựng cũng như lợi thế của địa phương như khai thác đá Granit...